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JEMBOSS 基礎課程 |
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主辦單位：國家衛生研究院、基因體醫學國家型科技計畫 |
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時間：95年9月20、21日(星期三、四)，為兩天之課程內容 |
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上課人數： 50人 |
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地點：中央研究院生命科學圖書館電腦教室 |
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9月20日課程： |
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09：00 - 09：50 |
國衛院生物資訊服務簡介 |
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09：50 - 10：10 |
JEMBOSS系統簡介及基本操作
汪詩海先生
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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10：10 - 10：50 |
資料庫及 EMBOSS 程式簡介：showdb, wossname
汪詩海先生
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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10：50 - 11：00 |
休息 |
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11：00 - 11：30 |
序列格式介紹，序列擷取、格式轉換：seqret
汪詩海先生
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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11：30 - 12：00 |
以文字搜尋資料庫：Entrez, ExPASy, EBI, SRS
汪詩海先生
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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12：00 - 13：30 |
午餐 |
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13：30 - 13：50 |
上午課程練習 |
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13：50 - 14：30 |
序列比對分析基本概念
李桂玉女士
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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14：30 - 15：00 |
資料庫搜尋比對及練習：BLAST
李桂玉女士
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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15：00 - 15：10 |
休息 |
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15：10 - 15：50 |
JEMBOSS序列比對程式簡介：needle, water, emma, showalign, prettyplot
李桂玉女士
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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15：50 - 16：20 |
下午課程練習 |
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9月21日課程： |
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09：30 - 10：10 |
JEMBOSS序列分析程式簡介：remap, getorf, plotorf
王旭川女士
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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10：10 - 10：40 |
JEMBOSS序列剪接、編輯程式：cutsed, showfeat, Revseq, Merger
王旭川女士
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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10：40 - 10：50 |
休息 |
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10：50 - 11：10 |
JEMBOSS引子預測程式：primer3
王旭川女士
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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11：10 - 11：50 |
JEMBOSS蛋白質特性分析程式：pepstats, charge, hmoment, pepwheel, garnier
王旭川女士
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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11：50 - 13：30 |
午餐 |
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13：30 - 13：50 |
上午課程練習 |
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13：50 - 14：30 |
JEMBOSS蛋白質pattern搜尋：patmatmotifs, fuzzpro, pscan
汪詩海先生
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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14：30 - 14：40 |
休息 |
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14：40 - 15：30 |
EMBOSS GUI 介紹
汪詩海先生
國家衛生研究院 研究資源處 生醫資訊服務組 |
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15：30 - 16：00 |
下午課程練習 |
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